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Genetic Association Test for Multiple Traits at Gene Level

机译:基因水平上多种性状的遗传关联测试

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摘要

Genome-wide association studies (GWASs) at the gene level are commonly used to understand biological mechanisms underlying complex diseases. In general, one response or outcome is used to present a disease of interest in such studies. In this study, we consider a multiple traits association test from the gene level. We propose and examine a class of test statistics that summarizes the association information between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and each of the traits. Our simulation studies demonstrate the advantage of gene-based multiple traits association tests when multiple traits share common genes. Using our proposed tests, we reanalyze the dataset from the Study of Addiction: Genetics and Environment (SAGE). Our result validates previous findings while presenting stronger evidence for consideration of multiple traits.
机译:在基因水平上的全基因组关联研究(GWAS)通常用于了解复杂疾病的生物学机制。通常,在这种研究中使用一种反应或结果来表达目标疾病。在这项研究中,我们考虑从基因水平的多重性状关联测试。我们提出并检查了一类测试统计数据,该统计数据总结了单核苷酸多态性(SNP)与每个特征之间的关联信息。我们的模拟研究证明了当多个性状共享共同的基因时,基于基因的多重性状关联测试的优势。使用我们提出的测试,我们重新分析了《成瘾研究:遗传与环境》(SAGE)中的数据集。我们的结果验证了先前的发现,同时为考虑多个特征提供了更有力的证据。

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