Изучение гомологичной рекомбинации и хромосомных перестроек в штаммах Escherichia coli, несущих гетерозиготную тандемную дупликацию

摘要

Гетерозиготные тандемные дупликации, образующиеся в конъюгационных скрещиваниях у Escherichia coli, представляют удобную модельную систему для изучения эволюции бактериальной хромосомы. Гетерозиготные дупликации выщепляют разнообразные классы гаплоидных и диплоидных рекомбинантов, образующихся в результате неравного кроссинговера между сестринскими хромосомами. В настоящей работе мы исследовали протяженную тавдемную дупликацию в области deo-оперона у E. coli, несущую аллели deoA deoB::Tn5/deoC deoD йг::Тп9. Изучали рекомбинацию между гомологичными повторами ДНК в дупликации в штаммах, несущих различные комбинации мутаций recBC, sbcBC, recB::Tn10, recQ::Tn3 и recF::Tn3. Частота рекомбинации между гомологичными повторами ДНК у всех штаммов очень высокая и не понижается при одновременном повреждении путей рекомбинации RecBCD и RecF в генотипе recB sbcBC recQ (или reef). Предполагается, что неравный кроссинговер между прямыми повторами ДНК в дупликациях может протекать по особому пути "адаптивной" рекомбинации.