АНАЛИЗ НУКЛЕОТИДНОГО РАЗНООБРАЗИЯ ПО ГЕНАМ ЦИТОХРОМА b И ЦИТОХРОМОКСИДАЗЫ 1 НА ПОПУЛЯЦИОННОМ, ВИДОВОМ И РОДОВОМ УРОВНЯХ

摘要

Проанализированы алгоритмы мер нуклеотидного разнообразия и другие меры генетической дивергенции на молекулярном уровне. На основе базы данных пор-расстояниям проведено сопоставление генетической дивергенции в популяциях (1) и в таксонах различного ранга, таких как близнецовые виды (2), виды одного рода (3). виды различных родов одного семейства (4). Исходя из теории и алгоритмов расчета расстоянии по первичным последоватепьностям ДНК. а также фактических оценок по литературным источникам, рекомендуется при анализе собственных данных специальноподбирать подходящую модель из восьми имеющихся. В то же время эмпирические данные для более чем 24000 видов позвоночных и беспозвоночных животных убеждают в реалистичности и интерпретируемости полученных рядов данных по p-расстоянию или его различным оценкам. Это является свидетельством применимости данной меры для большинства внутривидовых и межвидовых сравнений генетической дивергенции до уровня семействапо двум сопоставленным генам. Данные по p-расстоянию выявляют различные и увеличивающиеся уровни генетической дивергенции последовательностей сопоставленных генов Cvt-b и Со-1 в четырех проанализированных группах сравнения. Средние невзвешенные значения расстояний для четырех групп равны: Cyt-b 1.55 ± 0.56 (1). 5.52 ± 1.34 (2), 10.69 ± 1.34 (3). 18.51 ±2.09(4) и Co-1 0.55 ± 0.19 (1). 4.91 ±0.83 (2). 9.66 + 0.72(3). 14.69 ± 1.02 (4). Выявляются также различия между самими генами в степени дивергенции на четырех проанализированных уровнях, хотя суммарные средние расстояния по двум генам статистически значимо не отличаются. Это согласуется с многочисленными данными о разной скорости эволюции этих и других генов и их различных участков и неоднородности темпов эволюции. Результаты проведенного анализа нуклеотидной, а также аллозимной дивергенции в пределах видов и в таксонах животных разного ранга, во-первых, хорошо согласуются с другими данными этого рода, включая и белковые маркеры генов, и. во-вторых, эти данныепозволяют сделать обобщение о том. что в животном мире на молекулярном уровне преобладает филетическая эволюция, а видообразование идет восновном по типу D1 (географическая модель). Преобладание типа видообразования D1 не означает отсутствия других типов. Их имеется не менее семи. Распознавание различных способов видообразования это задача, на пути решения которой видится построение количественной генетической модели (теории) видообразования. Хотя, учитывая огромное разнообразие возможных причин возникновения репродуктивных изолирующих барьеров (РИБ) и инициирования видообразования, а также "эмпиризм" предлагаемого в работе формализованного подхода, возможно, и не всегда найдется ответ на некоторые вновь возникающие вопросы. Их решение, очевидно, лежит в увеличении числа дескрипторов и членов уравнений, предлагаемых в статье, за счет ДНК-маркеров и других геномных характеристик.