КЛАССИФИКАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ СКРЫТОЙ ДИНУКЛЕОТИДНОЙ ПЕРИОДИЧНОСТИ ГЕНОМОВ РАСТЕНИИ

摘要

Метод информационного разложения (ИР) был применен для поиска в геномах растении последовательностей, обладающих динуклеотидной периодичностью, в том числе и скрытой С помощью этого метода было найдено 14766 последовательностей, обладающих периодом длины 2 нуклео в последовательностях ДНК из геномов разнообразных растений банка данных GenBank. Затем мы классифицировали матрицы периодичности найденных последовательностей и в результате получили что в известных последовательностях ДНК из геномов разнообразных растении встречается всего 141 класс динуклеотидной периодичности. Так как метод ИР не обнаруживает периодичности с делециями и вставками нуклеотидов. то мы использовали полученные классы и метод модиф рованного профильного анализа (МПА) для выявления последовательностей ДНК с динуклеотидной периодичностью, которая содержит делеции и вставки нуклеотидов. Суммарно методы V МПА позволили найти 80396 последовательностей ДНК из геномов разнообразных растении, которые обладают динуклеотидной периодичностью. Обсуждается биологическое значение диную тидной периодичности в найденных последовательностях.