РАЗНООБРАЗИЕ И ЭВОЛЮЦИЯ LTR-РЕТРОТРАНСПОЗОНОВ В ГЕНОМЕ ГРИБА Phanerochaete chrysosporium (Fungi: Basidiomycota)

摘要

На сегодняшний день разнообразие мобильных элементов, и в частности LTR-ретротранспозонов, грибов-базидиомицетов слабо изучено. Используя полные геномные последовательности, впервые был проведен поиск LTR-ретротранспозонов в геноме лигнин-разлагающего гриба Phanerochaete chrysosporium.Обнаружено необычно высокое разнообразие LTR-ретротранспозонов. Описано 23 новых мобильных элемента, относящихся к двум надсемействам -- Pseudoviridae и Metaviridae. Доля LTR-ретротранспозонов в геноме P. chrysosporium невелика, всего около 3%. Тем не менее LTR-pe-тротранспозоны P. chrysosporium представляют собой динамичную составляющую генома, о чем свидетельствует наличие интактных копий с признаками недавнего перемещения и множество соло LTR-элементов. Филогенетический и структурный анализы выявили мобильные элементы, обладающие характеристиками, неизвестными ранее для других LTR-ретротранспозонов.