СЕКВЕНИРОВАНИЕ И АНАЛИЗ РЕЗИСТОМА Streptomyces fradiae АТСС19609 С ЦЕЛЬЮ РАЗРАБОТКИ ТЕСТ-СИСТЕМЫ ДЛЯ СКРИНИНГА НОВЫХ АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫХ ВЕЩЕСТВ

摘要

В работе приводится аннотация и данные секвенирования генов устойчивости к антибиотикам штамма Streptomycesfradiae АТСС19609, сверхчувствительного к различным антибиотикам. Анализ генома выявил четыре группы генов, определяющих резистом исследуемого штамма: классические гены устойчивости к антибиотикам (девять генов аминогликозидфосфотрансфераз, два гена бета-лактамаз, пуромицин-М-ацетилтрансферазы, фосфотрицин-]М-ацетилтрансферазы, аминоглико-зид-ацетилтрансферазы); гены АТФ-зависимых белков ABC транспортеров, участвующих в выбросе антибиотиков из клетки (МасВ-2, ВсгА, двусубъединичный MDR1); гены позитивной и негативной регуляции транскрипции (семейства whiB, padR) и посттрансляционной модификации (серин-треонин протеинкиназ). Дана сравнительная характеристика генов аминогликозидфосфотрансфераз S.fradiae АТСС19609, S. lividansTK24 и S. albus J1074, возбудителя актиномикоза. Показана возможность использования штамма S. fradiae АТСС 19609 в качестве тест-системы для отбора производных макролидного антибиотика олигомицина А с различными уровнями активности. Анализ более 20 полусинтетических производных олигомицина А позволил разделить их на три группы по уровню активности: неактивные (>1 нмоль/диск) — 10 веществ, обладающие средним уровнем активности (0.05—1 нмоль/диск) — 12 веществ, более активные (0.01—0.05 нмоль/диск) — 2 вещества. Существенным для активности полусинтетических производных является изменение в положении 33-го атома углерода в молекуле олигомицина А.