ПОЛНЫЙ ГЕНОМ Bifidobacterium angulatum GT102. II. СИСТЕМЫ СИГНАЛЬНОЙ ТРАНСДУКЦИИ И АДАПТИВНЫЕ ГЕНЫ

摘要

Вид Bifidobacterium angulatum встречается в кишечной микробиоте человека гораздо реже по сравнению с преобладающими видами Bifidobacterium longum и Bifidobacterium adolescentis. Вероятно, это связано с различной способностью данных видов к колонизации кишечника и взаимодействию с клетками организма-хозяина.Предметом данного исследования были гены систем сигнальной трансдукции и адаптивные гены в геноме В. angulatum GT102. Обнаружена уникальная длявида В. angulatum гистидиновая киназа НК10, принадлежащая к QseC семейству киназ, среди которых встречаются бактериальные адренергические рецепторы. Показана существенная разница в структуре сенсорного С-концевого домена видоспецифической серин-треониновой протеинкиназы Pkb2 у В. angulatum и у видов В. adolescentis и В. longum, что может указывать на взаимодействие данного домена с различными лигандами. У белка-адгезина FN3 В. angulatum, содержащего два фибронектино-вых домена типа 3 с мотивами цитокиновьгх рецепторов, аминокислотная последовательность второго мотива цитокинового рецептора уникальна и отличается от мотивов, характерных для других видов би-фидобактерий человека, что может быть причиной различий во взаимодействии вида В. angulatum с иммунной системой хозяина. В отличие от В. adolescentis и В. longum в геноме В. angulatum GT102 не были найдены гены, кодирующие системы токсин—антитоксин II типа суперсемейств MazEF, RelBE и VapBC, отвечающих за адаптацию бактерий к меняющимся условиям окружающей среды. Сравнительный анализ генов, дающих бактерии конкурентные преимущества и участвующих во взаимосвязи бифидобактерий с клетками хозяина, указывает на меньшие возможности у В. angulatum для успешной колонизации кишечника по сравнению с доминирующими видами бифидобактерий В. adolescentis и В. longum.