ИЗМЕНЧИВОСТЬ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ В РАЙОНЕ ITS1-5.8S pPHK-ITS2a-2S pPHK-ITS2 КЛАСТЕРА ГЕНОВ рРНК У ВИДОВ СЕМЕЙСТВА Chironomidae

摘要

Изучали изменчивость нуклеотидных последовательностей рибосомных генов и внутренних транскрибируемых спейсеров, расположенных в районе ITS 1—5.8S рРНК—ITS2a—2S рРНК—ITS2, разделяющем гены 18S и 28S рРНК в кластере генов рРНК, с целью оценить возможность использования этих последовательностей в качестве молекулярных маркеров для идентификации видов и реконструкции филогении семейства Chironomidae. Установили, что у видов семейства Chironomidae доля AT пар нуклеотидов в последовательностях генов 5.8S рРНКи 2S рРНКниже (50—57%), чем в последовательностях внутренних транскрибируемых спейсеров ITS 1, ITS2an ITS2 (64—71%). Размеры нуклеотидных последовательностей генов 5.8S рРНК (123 пн) и 2S рРНК (30 пн) у видов семейства Chironomidaeконсервативны, а размеры внутренних транскрибируемых спейсеров ITS 1, ITS2a и ITS2 варьируют как внутри вида, так и между видами. В последовательностях гена 2S рРНК у 27 видов из пяти родов семейства Chironomidae не обнаружено ни внутривидовых, ни межвидовых, ни межродовых различий нуклеотидов. Нуклеотидные последовательности гена 5.8S рРНК идентичны у большинства изученных видов рода Chironomus. Фиксированные межвидовые замены нуклеотидов найдены только в двух сайтах последовательности этого гена у трех видов: С. piger, С. riparius (4730Т) и С. annularius (474A>G). Число инсерций, делеций и замен нуклеотидов в последовательностях внутренних транскрибируемых спейсеров ITS1, ITS2a, ITS2 и всего района ITS1—5.8S рРНК—ITS2a—2S рРНК—ITS2 в целом низкое внутри видов, увеличивается в 5—6 раз у видов-двойников и более чем в 10 раз — у морфологически различимых видов, то есть растет в соответствии с ростом таксономического статуса видов семейства Chironomidae. Полученные данные свидетельствуют о том, что нуклеотидные последовательности рибосомных генов и внутренних транскрибируемых спейсеров из района ITS 1 — 5.8S pPHK-ITS2a—2S рРНК—ITS2 кластера генов рРНК, могут быть использованы в качестве молекулярных маркеров для идентификации видов и реконструкции филогении семейства Chironomidae.