ОПЫТ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ТЕХНОЛОГИИ FTA~R ДЛЯ СБОРА, АРХИВИРОВАНИЯ И МОЛЕКУЛЯРНОГО АНАЛИЗА ДНК МИКРОСПОРИДИЙИЗ КЛИНИЧЕСКИХ ОБРАЗЦОВ

摘要

Технология FTA~R впервые была испытана для сбора, архивирования и молекулярного анализа ДНК, содержащейся в образцах стула, с целью выявления и идентификации микроспоридий — внутриклеточных оппортунистических паразитов, вызывающих поражение кишечника и синдром мальабсорбции у людей с ослабленной иммунной системой, в частности у больных СПИДом. ДНК микроспоридий была успешно амплифицирована в 6 из 50 образцов стула ВИЧ-инфицированных пациентов Клинической инфекционной больницы им. С. П. Боткина (Санкт-Петербург). Образцы наносили на специально обработанную фильтровальную бумагу (FTA-Cards, Whatman Inc. Florham Park, NJ, США). Ампликоны (фрагменты гена рибосомной РНК) были прочитаны прямым секвенированием. Виды микроспоридий — Еп-cephalitozoon intestinalis, Е. cuniculi, Е. hellem и Enterocytozoon bieneusi — идентифицированы по данным Банка генов с помощью программы NCBI BLAST. Данный метод иммобилизации ДНК на фильтровальной бумаге особенно перспективен для эпидемиологических и популяционно-полевых исследований, требующих генотипирования видов и изолятов микроспоридий.