МУЛЬТИЛОКУСНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ CORYNE-BACTERIUM DIPHTHERIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ В РОССИИ В 2002 - 2012 ГГ.

摘要

Цель. Характеристика современных штаммов C.diphtheriae, выделенных в России, с помощьюмультилокусного секвенирования ДНК(MLST); Материалы иметоды. Изучено 28 токсигенных штаммов Cdiphtheriae, выделенных в России в 2002-2012 гг. и присланных в референс-центр по дифтерии и коклюшу МНИИЭМ им. Г.Н.Габричевского. Генотипирование штаммов С. diphtheriae с помощью MLST проводили на основе секвенирования фрагментов генов atpA, dnaE, dnaK, fusA, leuA, odhA и rpoB. Идентификацию аллелей и ST осуществляли согласно EMBL/GenBank и PubMLST, для кластерного анализа использовали eBurst подход. Результаты. С помощью MLST охарактеризованы современные токсигенные штаммы C.diphtheriae, выделенные в России в 2002 -2012 гг. Идентифицировано 8 генотипов (ST41, ST5, ST8, ST28, ST25, ST44, ST-newl и ST-new2), доминирующими среди которых были три-ST8, ST28 и ST-newl. Большинство токсигенных штаммов принадлежат к биовару gravis и ST8. Среди штаммов биовара mitis отмечается большая гетерогенность по Принадлежности к ST, но с преимущественным преобладанием штаммов ST28. Заключение. Использование MLST позволило охарактеризовать современную циркулирующую популяцию токсигенных штаммов C.diphtheriae, вьщеленных в России, и показало перспективность применения этого метода для характеристики популяции возбудителя дифтерии и выявления эпидемически значимых штам-мов, а также сопоставления их с генетической структурой зарубежных штаммов.