ゲノム進化学の展開　4－近接結合法をはじめとする距離行列法

摘要

本連載の過去2回は，系統樹の様々な性質について説明した．この回では，まず系統樹を復元する方法の概要について論じた後，そのなかの距離行列法について少し詳しく論じる．系統樹作成法は，用いるデータの種類によって，距離行列法と形質状態法に二分することができる．前者は，「進化距離行列」（evolutionary distance matrix）を用いて系統樹を復元するものであり，後者はDNAの塩基配列やタンパク質のアミノ酸配列などの配列データ（進化学ではより一般的に「形質状態」（character state）と呼ぶ）を用いる．