蛋白質の構造から機能推定へ:構造バイオインフォマティクスによる解析

摘要

“タンパク3000プロジェクト”は，蛋白質立体構造の迅速な決定システムの開発と，3000個程度の新規な蛋白質構造の決定がミッションとされた．数字をミッションとすることは一見わかりやすいが，“新規な蛋白質構造”の定義は必ずしも自明ではなく，客観的な整理が必要である．本稿では，まずこのプロジェクトで決定された蛋白質の新規性に対する，バイオインフォマティクスによる調査結果を紹介する．そして，既知蛋白質のホモログでないとされた新規蛋白質に対して構造からの機能推定を試みたので，その手法と結果を紹介する．