БАКТЕРИАЛЬНЫЕ БЕЛКИ СВОРАЧИВАЮТСЯ БЫСТРЕЕ,ЧЕМ ЭУКАРИОТИЧЕСКИЕ БЕЛКИ С ПРОСТОЙКИНЕТИКОЙ СВОРАЧИВАНИЯ

摘要

Проведен статистический анализ встречаемости белковых доменов и их распределения по царствам для структурной базы SCOP. Оказалось, что среди отобранных белковых доменов с наилучшим разрешением эукариотические белки чаще относятся к структурным классам а-спиральных и (3-структурных белков, а белки бактериального происхождения к структурному классу α/β. С помощью статистического анализа скоростей сворачивания 73 белков с известными экспериментально полученными данными обнаружено, что бактериальные белки с простой кинетикой (23 белка) сворачиваются быстрее, чем эукариотические белки с простой кинетикой сворачивания (27 белков). Анализ аминокислотного состава белковых доменов показал, что встречаемость аминокислотных остатков белков эукариотического и бактериального происхождения различна для белков с простой и со сложной кинетикой сворачивания.