ГИБРИДИЗАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ С ПОМОЩЬЮ ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫХ ПРОИЗВОДНЫХ. III. СИНТЕЗ И ИССЛЕДОВАНИЕ СВОЙСТВ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ, НЕСУЩИХ БИФУНКЦИОНАЛЬНУЮ НЕНУКЛЕОТИДНУЮ ВСТАВКУ

摘要

Синтезированы ненуклеотидные амидофосфиты, обладающие разветвленным каркасом с различным расположением функциональных групп. Полученные амидофосфитные мономеры содержат остаток интеркалятора — 6-хлор-2-метоксиакридина, и гидроксильную группу, блокированную дополнительной диметокситритильным остатком, либо mpem-бутилдиметилсилильной защитой для постсинтетической модификации. Синтезированы олиготимидилаты, содержащие одно или несколько модифицированных звеньев в различных положениях последовательности. Определены температуры плавленияи термодинамические параметры (изменение энтальпии и энтропии) формирования комплементарных комплексов, образованных модифицированнымиолигонуклеотида-ми. Продемонстрировано, что введение звена, содержащего интеркалирующий остаток, вызывает значительную стабилизацию ДНК-дуплексов. Показано, что эффективность флуоресценции остатка акридинового производного в составе олигонуклеотидного конъюгата значительно изменяется при его комплексообразовании с ДНК.