Webデ一夕ベース'CATchUP:時空間特異的発現遺伝子の網羅的探索とデータベース構 築

摘要

発芽や生殖，環境応答性など農作物におけ る重要な生物学的プロセスを理解する上で, 時間的'空間的に特異的に発現する遺伝子（時 空間特異的発現遺伝子）群は重要な手がかり となる.公共データベース上に蓄積している ゲノムゃトランスクリプト一ムなどの大規模 なォミツタス情報は，時空間特異的発現遺伝 子を網羅的に探索するための基盤情報とな る.本研究では，それら大規模なォミックス情 報から時空間特異的発現遺伝子を網羅的、効 率的に探索ためのアルゴリズムを開発し，大規模RNA-Seqデータを用いた遺伝子探索を 実施した.これらの候補遺伝子群の情報は，当 プロジヱクト力《構築、運営しているWebデー 夕ベースCATchUP (http://plantomics.mind. meiji.acjp/CATchUP/)から提供している.