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アフリカ栽培イネのゲノム育種利用を目指した基盤構築

机译:建立利用非洲栽培稻的基因组育种的基础

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摘要

近年の気候変動に対応したイネ育種を考え たとき、様々なストレス耐性を持つとされるァフリ力栽培ィネO. glaberrimaは重要な遺伝資源である。O. glaberrimaを効率よく育種利用するためには、正確なゲノム情報などにアクセス可能な環境が必須である。0.glaberrimaのゲノム情報は、EnsemblPlants上で公開されているものがある。しかし、デ一夕の欠落が多く信頼性に欠ける部分があり、データ品質もアクセスの容易さも十分とは言い難い。そこで、O. glaberrimaを利用したゲノム育種を可能にする基盤構築のため、ゲノ ムデータベースを構築した。さらに、173系統のO. glaberrima品種コレクションの全ゲ ノム多型データを取得し、ゲノムデータべ一 スに統合した。また得られた多型データを用 いて、いくつかの農業形質(草丈、葉サイズ、 種子サイズなど)についてゲノムワイド関連 解析(GWAS)を行った。
机译:考虑到近年来支持气候变化的水稻滋生,认为既往是AFLI功率培养的各种胁迫抗性.Glaberrima是一个重要的遗传资源。为了有效地使用O.Glaberrima,可以访问准确的基因组信息等的环境至关重要。 0. Glaberrima Genome信息发布在集成架上。但是,有一部分缺少缺失的矮人并缺乏可靠性,并且很难说数据质量和访问的易用性就足够了。因此,我们构建了一种基因组数据库,用于基础结构,其允许使用Glaberrima进行基因组繁殖。此外,获得了173O.Glaberma品种收集的所有基因组多态性数据,并集成到基因组数据库中。此外,使用所得多晶型数据对几种农业特征(草高,叶片尺寸,种子等)进行基因组杂于相关的分析(GWAs)。

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