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【24h】

ICBdocker: a Docker image for proteome annotation and visualization

机译:ICBDocker:用于蛋白质组辅助和可视化的Docker图像

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摘要

A Summary: We introduce ICBdocker, a Docker environment that allows the annotation of functional and structural features of proteomes through a Python/Perl pipeline. DataTables pages make it easy to set up a web-resource for research groups with a focus on the same organisms or datasets. The results are available as tab-separated values files and HTML, allowing data analysis and browsing. The pipeline focuses on modularity and scalability, with capability of integrating with multiprocessing and high-performance computing clusters.
机译:摘要:我们介绍了ICBDocker,允许通过Python / Perl管道注释蛋白质的功能和结构特征。 DataTables Pages可以轻松为研究组设置Web资源,以侧重于同一生物或数据集。 结果可用作标签分隔的值文件和HTML,允许数据分析和浏览。 管道侧重于模块化和可扩展性,具有与多处理和高性能计算集群集成的能力。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2018年第22期|共2页
  • 作者

    Bordin Nicola; Devos Damien P.;

  • 作者单位

    Univ Pablo de Olavide Lab Evolutionary Innovat Ctr Andaluz Biol Desarollo CSIC Carretera Utrera Seville 41013 Spain;

    Univ Pablo de Olavide Lab Evolutionary Innovat Ctr Andaluz Biol Desarollo CSIC Carretera Utrera Seville 41013 Spain;

  • 收录信息
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 生物工程学(生物技术);
  • 关键词

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