PWMScan: a fast tool for scanning entire genomes with a position-specific weight matrix

Ambrosini Giovanna; Groux Romain; Bucher Philipp

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PWMScan: a fast tool for scanning entire genomes with a position-specific weight matrix

机译：PWMSCAN：一种快速工具，用于扫描具有特定位置的重量矩阵的整个基因组

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A Summary: Transcription factors regulate gene expression by binding to specific short DNA sequences of 5-20 bp to regulate the rate of transcription of genetic information from DNA to messenger RNA. We present PWMScan, a fast web-based tool to scan server-resident genomes for matches to a user-supplied PWM or transcription factor binding site model from a public database.

机译：概述：转录因子通过与5-20bp的特异性短DNA序列结合来调节基因表达，以调节从DNA到信使RNA的遗传信息的转录速率。我们呈现PWMSCAN，一种快速的Web的工具来扫描服务器驻留基因组，用于与公共数据库中的用户提供的PWM或转录因子绑定站点模型匹配。

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来源
《Bioinformatics》 |2018年第14期|共2页
作者
Ambrosini Giovanna; Groux Romain; Bucher Philipp;
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作者单位

Swiss Fed Inst Technol Lausanne EPFL Swiss Inst Expt Canc Res ISREC CH-1015 Lausanne Switzerland;

Swiss Fed Inst Technol Lausanne EPFL Swiss Inst Expt Canc Res ISREC CH-1015 Lausanne Switzerland;

Swiss Fed Inst Technol Lausanne EPFL Swiss Inst Expt Canc Res ISREC CH-1015 Lausanne Switzerland;

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原文格式 PDF
正文语种 eng
中图分类生物工程学（生物技术）;
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