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複数種類のシークェンサーを用いた配列解析戦略 メリツ卜と限界を見据えた次世代型シークェンサ一の活用方法,使い分け方法,組合せ方法

机译:使用多种类型的测序仪进行序列分析的策略如何利用,正确使用和组合下一代测序仪,并着眼于极限和极限

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摘要

次世代型シ一クェンサ一はその登場以降,そのスル一プットを急速に向上させ,最新のIllummina社HiSeq2000では1ラン2,000億塩基に達している,これはヒトケノムの60倍以上に相当し,この能力を活用した配列解析戦略が広まりつつある.その適応範画も拡大し,ゲノム再シーケンスによるSNP解析,遺伝子発現解析,塩基修飾探索,蛋白質結合領域探索などのほか,deww配列決定への応用も開始されている. -方,シークェンサ一は機種ごとに特徴があるので,その長新および短所を念頭に,解析対象や目的に応リて機種を選釈することが有効话用のポイントとなる.本稿では各シークェンサ一の特徴と话用ポイン卜を解説し,合わせてそれらの組合せによる解析の事例をとくに4青報処理の視点から紹介する.
机译:自推出以来,下一代系统已迅速提高了产量,最新的Illummina HiSeq2000每次运行已达到2000亿个碱基,这是人类血红蛋白的60倍以上。利用能力的序列分析策略正在变得广泛,应用范围已经扩大,除了通过基因组重排进行SNP分析,基因表达分析,碱基修饰搜索,蛋白质结合区搜索等以外,还可以用于露点测序。它已经开始了。由于每种模型都有其自身的特征,因此在考虑其优缺点的同时,根据分析目标和目的选择模型是有效的。在本文中,我们将解释每个音序器的特性和对话要点,并结合它们进行介绍分析示例,尤其是从4 Seiho处理的角度。

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