ГЕНОТИПИРОВАНИЕ МЕТОДОМ МУЛЬТИЛОКУСНОГО VNTR-АНАЛИЗА ШТАММОВ FRANCISELLA TULARENSIS, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ПРИРОДНЫХ ОЧАГОВ ТУЛЯРЕМИИ РОСТОВСКОЙ ОБЛАСТИ

摘要

Проведен анализ распределения аллелей VNTR у 109 штаммов F. tularensis, что позволило установить факт циркуляции на территории Ростовской области с 1945 по 2002 г. 19 генотипов возбудителя. Вызываемые микробом вспышки можно разделить на поликлональные, моноклональные и кластерные. Ретроспективный анализ распределения генотипов показывает, что на исследуемой территории одновременно циркулируют штаммы одного либо близкородственных генотипов. Все изученные штаммы F. tularensis удалось дифференцировать на 2 группы: к 1-й относятся штаммы, генотипы которых почти равномерно встречались на всей территории области; штаммы 2-й группы проявляли тенденцию к географической привязанности. Выделение культур с одинаковыми (близкими) генотипическими характеристиками через длительные промежутки времени позволяет предположить, что часть клонов F. tularensis может длительно персистировать в природных очагах. Охарактеризованный по генотипу набор штаммов может быть положен в основу базы данных культур туляремийного микроба геоинформационной системы Южного федерального округа России.