РАЗРАБОТКА НАБОРА РЕАГЕНТОВ В ФОРМАТЕ ДНК-ЧИПА ДЛЯ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE

摘要

Продолжение 7-й пандемии холеры, таксономическое разнообразие вовлеченных в пандемию штаммов Vibrio cholerae, a также постоянная опасность завоза заболевания на территорию Российской Федерации обусловливают необходимость разработки методов генной диагностики холеры, позволяющих за сравнительно короткое время максимачьно подробно охарактеризовать штаммы, выделяемые от пациентов или из окружающей среды. В статье представлена информация о создании набора реагентов для генотипирования возбудителей холеры с использованием ДНК-чипа. В состав ДНК-чипа были включены олигонуклеотидные зонды, позволяющие дифференцировать штаммы V.cholerae no серогруппам и био-варам, а также определить их патогенность. Один ДНК-чип позволяет генотипировать до 12 образцов одновременно, при этом время анализа без учета стадии выделения ДНК составляет 5 ч. В ходе работы было исследовано 23 штамма холерных и нехолерных вибрионов и показано полное соответствие результатов типирования на ДНК-чипе с ранее известными характеристиками штаммов. Таким образом, есть основания говорить о перспективности дальнейшей работы над набором реагентов и возможности последующего его применения в лабораториях регионального уровня и референсных центрах.