Близкородственные бактерии ВигкНоЫег'ш серааа сотрЫх (Вес) и АскготоЬас1ег зр. инфицируют респираторный тракт больных мукоеисцидозом, вызывая нарушения дыхательной проходимости. Вес отличает трансмиссивность и высокая летальность пациентов, зараженных буркхолдериями, поэтому дифференциация этих фенотипически сходных микроорганизмов представляется важной задачей. Разработанный экспресс-метод диагностики включает выделение ДНК из мокроты, амплификацию и секвенирование фрагментов генов гесА, фВ, §угВ, 168 гйИА. Оценка продуктов амплификации генов гесА, фВ позволяет дифференцировать Вес и АскютоЪас1ег зр. При анализе последовательностей генов гесА, фВ, дугВ был установлен генотип Вес на основе базы данных аллепьных профилей штаммов Вес, циркулирующих в РФ. По последовательности гена 168 гОМА можно определить таксономическое положение доминирующего в мокроте микроорганизма, не принадлежащего Вес или АскготоЬас1ег щ ПЦР в реальном времени в присутствии интеркалирую-щего красителя 8уЬг Огееп I, ЭМ50 и О(+)-трегалозы позволяет дифференцировать Все от других микроорганизмов, инфицирующих респираторный тракт больных мукоеисцидозом, дополнительно сократить время диагностики и снизить вероятность контаминации.
展开▼
