ИЗУЧЕНИЕ СТРУКТУРЫ МИКРОБНОГО СООБЩЕСТВА ПОЧВ РАЗНОЙ СТЕПЕНИ ЗАСОЛЕНИЯ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ T-RFLP И ПЦР С ДЕТЕКЦИЕЙ В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ

摘要

С использованием молекулярных методов изучены вариации в таксономической структуре бактериального, архейного и грибного сообществ в образцах почвы, отобранных из солончака в окрестностях оз. Акколъ, Шингирлау (Казахстан) по градиенту засоленности. В качестве контрольных образцов использовались почвы, расположенные в 195 км от солончака на полях сельскохозяйственного назначения. Из всех проб почвы выделяли тотальную ДНК и анализировали с использованием метода T-RFLP и ПЦР с детекцией в реальном времени. Показано, что основной экологической де-терминантой, определяющей структуру почвенного сообщества микроорганизмов в данном регионе, является засоленность. Во всех исследуемых образцах получены сходные значения индексов Сим пеона, характеризующих разнообразие микробного сообщества, при этом все пробы существенно различались по таксономическому составу микроорганизмов. В наиболее засоленном образце выявлено значительно более высокое содержание архей. Настоящее исследование демонстрирует, что структура почвенного сообщества микроорганизмов отражает особенности почвы и может быть использована как индикатор экологического состояния.