次世代シーケンサ一を用いたづenoレo卜ランスクリプトー厶解析

摘要

本技術ノー 卜では，次世代シーケンサーを用いた非モデ ル動物の全卜ランスクリプ卜一ム解析について説明する。これまで，非モデル動物のように参照となるゲノムDNA 情報がない場合，次世代シーケンサ一の配列デ一タを貼り 合わせて長い配列情報を得ることが難しかった。また，代 表機種である11 lumina社シーケンサーでは，他社機種に比 ベて安価で大量の配列デ一夕が得られるものの，シ一ケン スデータの配列長が短い。これら技術，費用の両問題によ り，次世代シーケンサ一による非モデル動物のトランスク リブトーム解析はなかなか進んでこなかった。最近になり， 卜ランスクリプ卜一ムデ一タ解析に特化した，参照配列を 必要としない配列貼り合わせ（ofenovo assembly)プログラ ムが複数発表されている。我々は，lllumina社シーケンサ一 とこれらのプログラムを用いて非モデル動物組織のofe novoシーケンス,卜ランスクリプト一ム解析を行い，良好 な結果を得た。これらの結果を含めて一連のofe nowトラ ンスクリプト一ム解析手法を紹介したい。