ФИЛОТИПЫ БАКТЕРИЙ, ОБИТАЮЩИЕ В ПИЩЕВАРИТЕЛЬНОМ ТРАКТЕ МОРСКОГО ЕЖА РАКАСЕМТКОТЮ ЫУШШ И АСЦИДИИ МIСВ.ОСОSМШ SP

摘要

Мы использовали секвенирование и филогенетический анализ ПЦР-амплифицированных 168 рДНК генов бактерий, живущих в пищеводе (глотке), желудке и кишечнике двух совместно обитающих видов морских беспозвоночных с различным механизмом питания: морского ежа Рагасеп(го1их 1тс1т (соскабливатель) и асцидии Мкгосохтт зр. (фильтратор). Амплифицироваиные последовательности ДНК выделены из всех исследованных участков тела, за исключением глотки асцидии. Исходя из предполагаемой филогении выделенных последовательностей, можно сделать вывод, что пищевод морского ежа заселен бактериями, относящимися преимущественно к группам а- и ■у-РгойоЪайепа и Вас1епоо!е1:е8; их источником, скорее всего, является окружающая среда. В желудке выявлены филотипы, относящиеся к у- и 5-Рго1еоЪас1епа, УегшсогшстоЫа и РизоЪасйпа. Большинство видов, близкородственных обнаруженным, являются анаэробами, поэтому выявленные последовательности могут относиться к предполагаемым симбионтам желудка Р. 1Мс1ш, в котором анаэробные условия преобладают. Из восьми филотипов, обнаруженных в кишечнике морского ежа, семь отнесены к сульфатредуцирующим 6-Рго1еоЬас1:епа и один вид - к у-Рго1еоЬае1епа. Последний вид, расщепляя сложные органические соединения, очевидно, участвует в процессе питания морского ежа, что может представлять определенные выгоды для хозяина. Бактериальные филотипы, выявленные в пищеварительном тракте асцидии, относятся исключительно к типам АсйпоЪас1ела и Рго1еоЬас(епа. Филотипы из желудка асцидии определены как патогенные для человека бактерии, источником которых, вероятно, служит водная толща. В то же время, в кишечнике асцидии обнаружены предполагаемые симбиотические бактерии, которые вовлечены в процесс расщепления азотистых и других органических соединений.