SNP解析技術の進展

摘要

SNPを用いたゲノムワイドな連鎖不平衡解析により多因子疾患の原因遺伝子を同定しよテという目標のもとに,数百万に及ぶSNPが公共データベースに登録され,さらにそれらのSNPを患者群および対照群の個人でタイピングして関連解析を行うための種々のハイスループットな技術が開発されている.しかし,実際に自分で興味のある遺伝子についてその領域のSNPで関連解析を行おうとすると,あらたにSNP検索を行うことが必要になることが多い.さらに,既知SNPはそのほとんどについてアレル頻度が不明であるため,解析に有用なSNPが判別できないという問題もある.PLACE-SSCP法はキャビラリー電気泳動に基づくSNP解析法で, SNP検出およびプールサンプルを用いたアレル頻度解析を精度よく効率よく行うことができる.さらに,この方法は関連解析においても有用であると期待される.