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多値論理を用いた生体ネットワークシステムのモデル検査(2012年5月28日版)

机译:使用多值逻辑的生物网络系统模型检查(2012年5月28日版本)

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摘要

近年,遺伝子制御系,シグナル伝達系や代謝系などの生体機構をひとつのシステムとして再構築する研究が進められている.実験機器のハイスループット化に伴い,生体システムに関与する観測データは急速に増加しており,システムと観測データ間の整合性を組織的に検証する技術が必要となってきている.本論文では,遺伝子制御系のようなネットワーク形式で表現される生体システムを多値論理の枠組みでモデル検査する手法を提案する.また酵母のグルコース抑制機構に関する生体ネットワークに対して本手法を適用した結果を報告する.
机译:近年来,已经进行了研究以重建诸如基因控制系统,信号转导系统和代谢系统的生物学机制作为一个系统。随着实验设备的吞吐量的增加,与生物系统有关的观测数据的数量迅速增加,并且需要技术来系统地验证系统与观测数据之间的一致性。在本文中,我们提出了一种在多值逻辑框架内对以网络格式表示的生物系统(例如基因控制系统)进行模型测试的方法。我们还报告了将该方法应用于与酵母的葡萄糖抑制机制有关的生物网络的结果。

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