メタゲノム解析のためのバイオインフォマティクス

摘要

1gの土壌中には10，000種類の微生物が存在するともいわれる．米国NCBI（National Center for Biotechnology Information）のデータベースに登録された微生物の平均ゲノムサイズが6.1 * 10~6bpであることから，仮に1遺伝子の平均サイズを1,000bpとすると，1gの土壌には6.1 * 10~(10)bpのDNAと6.1 * 10~7個の遺伝子が存在することになる. 一方，環境中に存在する微生物の99％以上は，現在の技術では単離培養ができないとされ，多くの未利用，もしくは未解析の微生物が存在すると考えられる．