ОЛИГО(2'-О-МЕТИЛРИБОНУКЛЕОТИДЫ) И ИХ ПРОИЗВОДНЫЕ. III. 5'-МОНО- И 5?-БИСПИРЕНИЛЬНЫЕ ПРОИЗВОДНЫЕ ОЛИГО(2'-О-МЕТИЛРИБОНУКЛЕОТИДОВ) И ИХ З'-МОДИФИЦ

摘要

Синтезированы 5'-пиренилметилфосфамидные и 5'-биспиренилметилфосфодиамидные производные олиго (2'-О-метилрибонуклеотидов) и их аналогов, содержащих на З'-конце тимидин, присоединенный 3'—З'-фосфодиэфирной межнуклеотидной связью ("инвертированный" тимидин). Изучено влияние остатка(ов) пирена на термическую стабильность дуплексов модифицированных олигонуклеотидов с РНК и ДНК. Продемонстрирована возможность детекции гибридизации 5'-моно- и 5'-биспиренильных производных с РНК- и ДНК-мишенями в растворе по изменению флуоресценции. Методом термической денатурации образующихся дуплексов, регистрируемой по изменению флуоресценции, показано, что 5'-пиренилметилфосфамидные производные олиго (2'-О-метилрибонуклеотидов) и их 3'-"инвертированных" аналогов являются чувствительными зондами для детекции однонуклеотидных замен в РНК и ДНК.