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ァヮにおけるゲノムワイドインデルマーカーの作出一分布、マッピング、多様性

机译:ヮ分布,作图,多样性中全基因组indel标记的创建

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摘要

【目的】これまで私たちはァヮ連鎖地図作成のためにゲノムをカバ一するようなSSRマー カーなどの作出を行つてきた(Sato et al. 2013, 瀧野ら2016)。近年、ァヮゲノムが解読され (Bennetzenetal. 2013)、また、次世代シークェ ンサ一の開発によりシリークェンシングも容 易となった。我々が現在展開している組換え 近交系(RILs)は、台湾品種と日本品種である が、このうち、片親の台湾品種JP73913につ いてはこれまでに、リシ一クェンシングを 行っている(向成ら2014)。本研究ではゲノ ム情報を用いて、我々のマツビング集団に利 用可能なゲノムワイドIndelマーカーを開発 するとともに、実際に連鎖地図作成に応用す るとともに、世界のァヮコレクション99品種 を用いてマーカーの多様度の調査を行った。
机译:[目的]到目前为止,我们已经创建了覆盖基因组的SSR标记,以创建链图(Sato等,2013; Takino等,2016)。近年来,已经破译了基因组(Bennetzenetal。2013),并且下一代测序仪的发展使得其更容易进行系列化。我们目前正在开发的重组不相干(RIL)是台湾品种和日本品种,其中,单亲台湾品种JP73913到目前为止已经进行了淬火处理( Mukai et al.2014)。在这项研究中,我们将使用基因组信息来开发可在我们的交配种群中使用的全基因组Indel标记,并将其实际应用于链作图,以及使用来自世界范围内的99个变种的标记。我们对多样性进行了调查。

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