土壌プロテォミクスから考える微生物生態系機能

摘要

単一細菌株について『土壌環境中でどのような生理状態や代 謝活性を行いながら生息しているのか？』.『ゲノム（遺伝子）は 存在する力, 土壌環境中では何力発現し，機能しているのか？』。 これらは，環境微生物学の重要課題である。生息中の細胞内の遺伝子発現プロフアイルがわかれば,(i) 土壌環境に応答した細菌 の代謝、生理状態を知るこができ，（ii)遺伝子の発現動態を知る ことで逆に細菌を取り卷く微小環境を推測することが可能にな る。この問題解決のために，私たちは，種々雑多で混沌とした環 境をもつ土壌生態系から特定の細菌が発現する遺伝子を検出する 効率的な解析法として，質量分析計を用いたプロテオーム解析法 を用いることによって，網羅的に高精度で発現タンパク質を検出 し同定することができ，得られるタンパク質プロファイルから時 系列、相違比較解析を容易に行えると考えた。