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【24h】

Optimizing Solute-Solute Interactions in the GLYCAM06 and CHARMM36 Carbohydrate Force Fields Using Osmotic Pressure Measurements

机译:使用渗透压测量优化GLYCAM06和CHARMM36碳水化合物力场中的溶质-溶质相互作用

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摘要

GLYCAM06 and CHARMM36 are successful force fields for modeling carbohydrates. To correct recently identified deficiencies with both force fields, we adjusted intersolute nonbonded parameters to reproduce the experimental osmotic coefficient of glucose at 1 M. The modified parameters improve behavior of glucose and sucrose up to 4 M and improve modeling of a dextran 55-mer. While the modified parameters may not be applicable to all carbohydrates, they highlight the use of osmotic simulations to optimize force fields.
机译:GLYCAM06和CHARMM36是用于建模碳水化合物的成功力场。为了纠正两个力场中最近发现的缺陷,我们调整了溶质非键合参数以重现1 M时的葡萄糖实验渗透系数。修改后的参数将葡萄糖和蔗糖的行为提高到4 M,并改善了葡聚糖55-mer的建模。尽管修改后的参数可能不适用于所有碳水化合物,但它们强调了使用渗透模拟来优化力场的方法。

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