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Genome-wide association scan identifies a prostaglandin-endoperoxide synthase 2 variant involved in risk of knee osteoarthritis.

机译:全基因组关联扫描确定了前列腺素-过氧化物过氧化物合酶2变异体与膝骨关节炎的风险有关。

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摘要

Osteoarthritis (OA), the most prevalent form of arthritis in the elderly, is characterized by the degradation of articular cartilage and has a strong genetic component. Our aim was to identify genetic variants involved in risk of knee OA in women. A pooled genome-wide association scan with the Illumina550 Duo array was performed in 255 controls and 387 cases. Twenty-eight variants with p < 1 x 10(-5) were estimated to have probabilities of being false positives
机译:骨关节炎(OA)是老年人中最普遍的关节炎形式,其特征是关节软骨退化,并具有很强的遗传成分。我们的目的是确定与女性患膝关节炎有关的遗传变异。使用Illumina550 Duo阵列对255个对照和387个病例进行了全基因组联合扫描。估计p <1 x 10(-5)的28个变体的假阳性概率<或= 0.5,并且分别在原始样品以及来自英国和美国的复制队列中分别进行了基因分型(599和272例) ,1530和258个控件)。随后对来自荷兰的样本中的前七个协会进行了测试(306例和584个对照)。在所有研究的队列中,将1号染色体上的5'映射到PTGS2和PLA2G4A基因的rs4140564与膝OA的风险相关(总体优势比OR(mh)= 1.55 95%CI 1.30-1.85,p <6.9 x 10(- 7))。从关节置换手术OA患者软骨中提取的PTGS2和mRNA的差异等位基因表达分析表明,等位基因表达存在显着差异(p <1.0 x 10(-6))。这些结果表明,在PTGS2内或附近以及与rs4140564之间的适度连锁不平衡中存在顺式作用调节多态性。我们的研究结果和有关PTGS2编码的环氧合酶2酶作用的先前研究强调了该信号通路在膝OA发病机理中的重要性。

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