IBM bouwt supercomputer voor ontrafelen eiwitten

摘要

Hoe een eiwit zich opvouwt is voor wetenschappers nog steeds een raadsel. Een keten van honderden aminozuren weet zich in zeer korte tijd zo te rangschikken dat een u-nieke biologische structuur ontstaat. De fundamentele processen worden nauwelijks begrepen. Door meer kennis hierover te verschaffen hopen wetenschappers ziekten beter te kunnen bestrijden. Met de huidige computertechnologie is het niet goed mogelijk de scheikundige processen na te bootsen. De computer zal alleen al een jaar lang moeten cijferen om de structuur van een enkel eiwit te voorspellen, terwijl er naar schatting 300.000 menselijke eiwitten bestaan. IBM wil daarom in vijf jaar een petafiop-compu-ter bouwen, genaamd Blue Gene. Deze computer kan veertig keer sneller rekenen dan de veertig snelste computers ter wereld bij elkaar. Blue Gene krijgt een miljoen processoren die elk een miljard berekeningen per seconde kunnen uitvoeren. Twee-endertig van deze snelle processoren (32 gigaflops) kunnen op een enkele chip worden geplaatst.