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Journal of Cheminformatics

Journal of Cheminformatics

中文名称：化学信息学杂志

ISSN：1758-2946
出版周期：-

发文量：847

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1.Computer-aided studies of molecular structure-comparison of measured and computed ECD spectra

机译：计算机辅助研究的分子结构比较，测量和计算的ECD光谱
- 作者：Richard Moha;Verena Gossen
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
2.Fragment-based identification of multi-target ligands by self-organizing map alignment

机译：通过自组织图谱比对，基于片段的多目标配体识别
- 作者：Janosch Achenbach;Franca-Maria Klingler;Steffen Hahn;Svenja Steinbrink;Mirjam Schroeder;Frank Loehr;Volker Doetsch;Dieter Steinhilber;Ewgenij Proschak
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
3.Effects of multiple conformers per compound upon 3-D similarity search and bioassay data analysis

机译：每个化合物多个构象异构体对3-D相似性搜索和生物测定数据分析的影响
- 作者：Sunghwan Kim;Evan E Bolton;Stephen H Bryant
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
4.How the methodology of 3D structure preparation influences the quality of QSPR models?

机译：3D结构准备的方法学如何影响QSPR模型的质量？
- 作者：Stanislav Geidl;Roman Beránek;Radka Svobodová Va?eková;Tomá? Bouchal;Miroslav Brumovsky;Michal Kudera;Ond?ej Sk?ehota;Jaroslav Ko?a
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
5.Molecular dynamics simulations and docking of non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs): a possible approach to personalized HIV treatment

机译：分子动力学模拟和非核苷逆转录酶抑制剂（NNRTIs）对接：个性化HIV治疗的一种可能方法
- 作者：Florian D Roessler;Oliver Korb;Andreas Bender;Werner Maentele;Peter J Bond
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
6.Ligand based lead generation - considering chemical accessibility in rescaffolding approaches via BROOD

机译：基于配体的铅生成-考虑通过BROOD在脚手架折叠方法中化学可及性
- 作者：Li-hsing Wang;Andreas Evers;Peter Monecke;Thorsten Naumann
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
7.Voting-based consensus clustering for combining multiple clusterings of chemical structures

机译：基于投票的共识聚类，用于组合化学结构的多个聚类
- 作者：Faisal Saeed;Naomie Salim;Ammar Abdo
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
8.Blind trials of computer-assisted structure elucidation software

机译：计算机辅助结构解析软件的盲试验
- 作者：Arvin Moser;Mikhail E Elyashberg;Antony J Williams;Kirill A Blinov;Joseph C DiMartino
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
9.Review of “Statistical Modelling of Molecular Descriptors in QSAR/QSPR” by Matthias Dehmer, Kurt Varmuza, and Danail Bonchev

机译：Matthias Dehmer，Kurt Varmuza和Danail Bonchev对“ QSAR / QSPR中分子描述符的统计建模”的评论
- 作者：Alexandru T Balaban
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
10.What's new in KNIME?

机译：KNIME有什么新功能？
- 作者：Thorsten Meinl
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
11.QSPR designer – employ your own descriptors in the automated QSAR modeling process

机译：QSPR设计器–在自动化QSAR建模过程中使用您自己的描述符
- 作者：Ond?ej Sk?ehota;Radka Svobodová Va?eková;Stanislav Geidl;Michal Kudera;David Sehnal;Crina-Maria Ionescu;Jan ?ídek;Jaroslav Ko?a
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
12.Structure-based classification and ontology in chemistry

机译：化学中基于结构的分类和本体
- 作者：Janna Hastings;Despoina Magka;Colin Batchelor;Lian Duan;Robert Stevens;Marcus Ennis;Christoph Steinbeck
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
13.DecoyFinder, a tool for finding decoy molecules

机译：DecoyFinder，用于发现诱饵分子的工具
- 作者：Cereto Massagué Adrià;S Garcia-Vallvé;G Pujadas
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
14.Simulating the drug discovery pipeline: a Monte Carlo approach

机译：模拟药物发现流程：蒙特卡洛方法
- 作者：Melvin J Yu
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
15.InChI: connecting and navigating chemistry

机译：InChI：连接和导航化学
- 作者：Antony J Williams
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
16.Molecular modeling of lipid drug formulations

机译：脂质药物制剂的分子模型
- 作者：Woldeamanuel A Birru;Dallas B Warren;Christopher JH Porter;Colin W Pouton;David K Chalmers
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
17.Making SharePoint? Chemically Aware?

机译：制作SharePoint ？化学意识？
- 作者：Kartik Tallapragada;Joseph Chewning;David Kombo;Beverly Ludwick
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
18.Probabilistic classifier: generated using randomised sub-sampling of the feature space

机译：概率分类器：使用特征空间的随机子采样生成
- 作者：Jonathan D Tyzack;Hamse Y Mussa;Robert C Glen
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
19.MoSGrid: efficient data management and a standardized data exchange format for molecular simulations in a grid environment

机译：MoSGrid：高效的数据管理和标准化的数据交换格式，用于网格环境中的分子模拟
- 作者：Georg Birkenheuer;Dirk Blunk;Sebastian Breuers;André Brinkmann;Ines dos Santos Vieira;Gregor Fels;Sandra Gesing;Richard Grunzke;Sonja Herres-Pawlis;Oliver Kohlbacher;Jens Krüger;Ulrich Lang;Lars Packschies;Ralph Müller-Pfefferkorn;Patrick Sch?fer;Thomas Steinke;Klaus-Dieter Warzecha;Martin Wewior
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
20.GCC2011 – 25 years of computational chemistry meetings

机译：GCC2011 – 25年的计算化学会议
- 作者：Frank Oellien;Uli Fechner;Thomas Engel
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
21.Aligning chemical structure diagrams with local search

机译：使化学结构图与本地搜索保持一致
- 作者：Matthias Hilbig;Matthias Rarey
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
22.InChI: a user’s perspective

机译：InChI：用户的观点
- 作者：Steven M Bachrach
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
23.Avogadro: an advanced semantic chemical editor, visualization, and analysis platform

机译：Avogadro：高级语义化学编辑器，可视化和分析平台
- 作者：Marcus D Hanwell;Donald E Curtis;David C Lonie;Tim Vandermeersch;Eva Zurek;Geoffrey R Hutchison
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
24.Mechanistic DFT studies – helicate-type complexes with different alcylic spacers

机译：机械DFT研究–具有不同的醇间隔基的螺旋型复合物
- 作者：Verena Gossen;Gerhard Raabe;Markus Albrecht
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
25.USRCAT: real-time ultrafast shape recognition with pharmacophoric constraints

机译：USRCAT：具有药效学约束的实时超快速形状识别
- 作者：Adrian M Schreyer;Tom Blundell
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
26.Improvements in docking scoring functions: the physics-based perspective

机译：对接计分功能的改进：基于物理学的观点
- 作者：Xavier Barril
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
27.Drug-likeness analysis of traditional Chinese medicines: 1. property distributions of drug-like compounds, non-drug-like compounds and natural compounds from traditional Chinese medicines

机译：中药的类药物分析：1.中药类药物，非类药物和天然化合物的性质分布
- 作者：Mingyun Shen;Sheng Tian;Youyong Li;Qian Li;Xiaojie Xu;Junmei Wang;Tingjun Hou
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
28.The GMX-Plugin for the CELLmicrocosmos MembraneEditor

机译：用于CELLmicrocosmos膜编辑器的GMX插件
- 作者：Sebastian Rubert;Christian Gamroth;André J Heissmann;Gunther Lukat;Ralf Rotzoll;Alexander Sch?fer;Jens Krüger;Bj?rn Sommer
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
29.Computational studies of flaviviruses: approaching to novel fusion inhibitors

机译：黄病毒的计算研究：寻求新型融合抑制剂
- 作者：Dmitry I Osolodkin;Liubov I Kozlovskaya;Galina G Karganova;Evgenia V Dueva;Vladimir A Palyulin;Nikolay S Zefirov;Vladimir M Pentkovski
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
30.Structured chemical class definitions and automated matching for chemical ontology evolution

机译：结构化的化学类别定义和化学本体进化的自动匹配
- 作者：Lian Duan;Janna Hastings;Paula de Matos;Marcus Ennis;Christoph Steinbeck
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
31.Performance of dispersion-corrected density functional theory for thermochemistry and non-covalent interactions

机译：色散校正密度泛函理论在热化学和非共价相互作用中的性能
- 作者：Waldemar Hujo;Stefan Grimme
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
32.Development of target-biased scoring functions for protein-ligand docking

机译：蛋白质配体对接的目标偏好评分功能的开发
- 作者：Michael Scharfe;Martin Pippel;Wolfgang Sippl
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
33.Winnow based identification of potent hERG inhibitors in silico: comparative assessment on different datasets

机译：基于Winnow的计算机有效hERG抑制剂的鉴定：不同数据集的比较评估
- 作者：Richard L Marchese Robinson;Robert C Glen;John BO Mitchell
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
34.Status of the InChI algorithm and InChI trust

机译：InChI算法的状态和InChI信任
- 作者：Stephen Heller
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
35.ChemProspector and generic structures: advanced mining and searching of chemical content

机译：ChemProspector和通用结构：高级挖掘和搜索化学成分
- 作者：Valentina Eigner-Pitto;Josef Eiblmaier;Hans Kraut;Larisa Isenko;Heinz Saller;Peter Loew
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
36.Quantifying intrinsic chemical reactivity of molecular structural features for protein binding and reactive toxicity, using the MOSES chemoinformatics system

机译：使用MOSES化学信息学系统量化分子结构特征对蛋白质结合和反应毒性的内在化学反应性
- 作者：Johannes AH Schw?bel;Bruno Bienfait;Johann Gasteiger;Thomas Klein?der;J?rg Marusczyk;Oliver Sacher;Christof H Schwab;Aleksey Tarkhov;Lothar Terfloth;Mark TD Cronin
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
37.A computational model for predicting the transport of compounds by ABCC2

机译：通过ABCC2预测化合物转运的计算模型
- 作者：Marta Pinto;Gerhard F Ecker
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
38.QSAR modeling for In vitro assays: linking ToxCast? database to the integrated modeling framework “OCHEM”

机译：用于体外测定的QSAR建模：链接ToxCast？数据库到集成建模框架“ OCHEM”
- 作者：Ahmed Abdelaziz;Iurii Sushko;Wolfram Teetz;Robert K?rner;Sergii Novotarskyi;Igor V Tetko
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
39.The assessment of computationally derived protein ensembles in protein-ligand docking

机译：蛋白质-配体对接中计算得出的蛋白质集合的评估
- 作者：Barbara Sander;Oliver Korb;Jason Cole;Jonathan W Essex
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
40.Systematic benchmark of substructure search in molecular graphs - From Ullmann to VF2

机译：分子图中子结构搜索的系统基准-从Ullmann到VF2
- 作者：Hans-Christian Ehrlich;Matthias Rarey
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2012年第s1期
41.Analysis of drug–endogenous human metabolite similarities in terms of their maximum common substructures

机译：药物内源性人类代谢物相似性的最大共同亚结构分析
- 作者：Steve O’Hagan;Douglas B. Kell
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
42.Nontargeted homologue series extraction from hyphenated high resolution mass spectrometry data

机译：联用高分辨率质谱数据的非靶向同源物系列提取
- 作者：Martin Loos;Heinz Singer
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
43.Mapping and classifying molecules from a high-throughput structural database

机译：从高通量结构数据库对分子进行映射和分类
- 作者：Sandip De;Felix Musil;Teresa Ingram;Carsten Baldauf;Michele Ceriotti
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
44.Database fingerprint (DFP): an approach to represent molecular databases

机译：数据库指纹（DFP）：一种表示分子数据库的方法
- 作者：Eli Fernández-de Gortari;César R. García-Jacas;Karina Martinez-Mayorga;José L. Medina-Franco
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
45.Comparative evaluation of atom mapping algorithms for balanced metabolic reactions: application to Recon 3D

机译：原子映射算法平衡代谢反应的比较评估：在Recon 3D中的应用
- 作者：German A. Preciat Gonzalez;Lemmer R. P. El Assal;Alberto Noronha;Ines Thiele;Hulda S. Haraldsdóttir;Ronan M. T. Fleming
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
46.S2RSLDB: a comprehensive manually curated, internet-accessible database of the sigma-2 receptor selective ligands

机译：S2RSLDB：sigma-2受体选择性配体的全面手动管理的，可通过互联网访问的数据库
- 作者：Giovanni Nastasi;Carla Miceli;Valeria Pittalà;Maria N. Modica;Orazio Prezzavento;Giuseppe Romeo;Antonio Rescifina;Agostino Marrazzo;Emanuele Amata
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
47.Technical implications of new IUPAC elements in cheminformatics

机译：化学信息学中新的IUPAC元素的技术含义
- 作者：John W. Mayfield;Roger A. Sayle
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
48.The power metric: a new statistically robust enrichment-type metric for virtual screening applications with early recovery capability

机译：功率指标：一种具有早期恢复能力的，适用于虚拟筛选应用的统计上强大的新型富集指标
- 作者：Julio Cesar Dias Lopes;Fábio Mendes dos Santos;Andrelly Martins-José;Koen Augustyns;Hans De Winter
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
49.Comprehensive identification of sphingolipid species by in silico retention time and tandem mass spectral library

机译：通过计算机保留时间和串联质谱库全面鉴定鞘脂种类
- 作者：Hiroshi Tsugawa;Kazutaka Ikeda;Wataru Tanaka;Yuya Senoo;Makoto Arita;Masanori Arita
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
50.Large-scale virtual screening on public cloud resources with Apache Spark

机译：使用Apache Spark对公共云资源进行大规模虚拟筛选
- 作者：Marco Capuccini;Laeeq Ahmed;Wesley Schaal;Erwin Laure;Ola Spjuth
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
51.Data driven polypharmacological drug design for lung cancer: analyses for targeting ALK, MET, and EGFR

机译：数据驱动的肺癌多药理药物设计：针对ALK，MET和EGFR的分析
- 作者：Dilip Narayanan;Osman A. B. S. M. Gani;Franz X. E. Gruber;Richard A. Engh
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
52.Nonpher: computational method for design of hard-to-synthesize structures

机译：Nonpher：难于合成的结构设计的计算方法
- 作者：Milan Vor?ilák;Daniel Svozil
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
53.Modeling framework for isotopic labeling of heteronuclear moieties

机译：同位素标记异核部分的建模框架
- 作者：Mark I. Borkum;Patrick N. Reardon;Ronald C. Taylor;Nancy G. Isern
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
54.The Chemistry Development Kit (CDK) v2.0: atom typing, depiction, molecular formulas, and substructure searching

机译：化学开发工具包（CDK）v2.0：原子类型，描述，分子式和子结构搜索
- 作者：Egon L. Willighagen;John W. Mayfield;Jonathan Alvarsson;Arvid Berg;Lars Carlsson;Nina Jeliazkova;Stefan Kuhn;Tomá? Pluskal;Miquel Rojas-Chertó;Ola Spjuth;Gilleain Torrance;Chris T. Evelo;Rajarshi Guha;Christoph Steinbeck
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
55.SkinSensDB: a curated database for skin sensitization assays

机译：SkinSensDB：用于皮肤敏化分析的精选数据库
- 作者：Chia-Chi Wang;Ying-Chi Lin;Shan-Shan Wang;Chieh Shih;Yi-Hui Lin;Chun-Wei Tung
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
56.ChemSAR: an online pipelining platform for molecular SAR modeling

机译：ChemSAR：用于分子SAR建模的在线流水线平台
- 作者：Jie Dong;Zhi-Jiang Yao;Min-Feng Zhu;Ning-Ning Wang;Ben Lu;Alex F. Chen;Ai-Ping Lu;Hongyu Miao;Wen-Bin Zeng;Dong-Sheng Cao
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
57.Helping to improve the practice of cheminformatics

机译：帮助改善化学信息学的实践
- 作者：Rajarshi Guha;Egon Willighagen
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
58.An algorithm to identify functional groups in organic molecules

机译：识别有机分子中官能团的算法
- 作者：Peter Ertl
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
59.Beyond the hype: deep neural networks outperform established methods using a ChEMBL bioactivity benchmark set

机译：超越炒作：使用ChEMBL生物活性基准测试集的深度神经网络的性能优于已建立的方法
- 作者：Eelke B. Lenselink;Niels ten Dijke;Brandon Bongers;George Papadatos;Herman W. T. van Vlijmen;Wojtek Kowalczyk;Adriaan P. IJzerman;Gerard J. P. van Westen
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
60.RANdom SAmple Consensus (RANSAC) algorithm for material-informatics: application to photovoltaic solar cells

机译：材料信息学的随机抽样共识（RANSAC）算法：在光伏太阳能电池中的应用
- 作者：Omer Kaspi;Abraham Yosipof;Hanoch Senderowitz
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
61.Searching for bioactive conformations of drug-like ligands with current force fields: how good are we?

机译：寻找具有当前力场的药物样配体的生物活性构象：我们有多好？
- 作者：Oya Gürsoy;Martin Smie?ko
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
62.Scaffold Hunter: a comprehensive visual analytics framework for drug discovery

机译：Scaffold Hunter：用于药物发现的全面可视分析框架
- 作者：Till Sch?fer;Nils Kriege;Lina Humbeck;Karsten Klein;Oliver Koch;Petra Mutzel
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
63.A novel descriptor based on atom-pair properties

机译：基于原子对性质的新型描述子
- 作者：Masataka Kuroda
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
64.Comparative analyses of structural features and scaffold diversity for purchasable compound libraries

机译：可购买化合物库的结构特征和支架多样性的比较分析
- 作者：Jun Shang;Huiyong Sun;Hui Liu;Fu Chen;Sheng Tian;Peichen Pan;Dan Li;Dexin Kong;Tingjun Hou
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
65.Deep-learning: investigating deep neural networks hyper-parameters and comparison of performance to shallow methods for modeling bioactivity data

机译：深度学习：研究深度神经网络的超参数并将性能与浅层方法进行生物活性数据建模的比较
- 作者：Alexios Koutsoukas;Keith J. Monaghan;Xiaoli Li;Jun Huan
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
66.QuBiLS-MAS, open source multi-platform software for atom- and bond-based topological (2D) and chiral (2.5D) algebraic molecular descriptors computations

机译：QuBiLS-MAS，开源多平台软件，用于基于原子和键的拓扑（2D）和手性（2.5D）代数分子描述符计算
- 作者：José R. Valdés-Martiní;Yovani Marrero-Ponce;César R. García-Jacas;Karina Martinez-Mayorga;Stephen J. Barigye;Yasser Silveira Vaz d‘Almeida;Hai Pham-The;Facundo Pérez-Giménez;Carlos A. Morell
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
67.Assessment of the significance of patent-derived information for the early identification of compound–target interaction hypotheses

机译：评估专利信息对早期识别复合靶相互作用假说的重要性
- 作者：Stefan Senger
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
68.chemalot and chemalot_knime: Command line programs as workflow tools for drug discovery

机译：chemalot和chemalot_knime：命令行程序作为药物发现的工作流工具
- 作者：Man-Ling Lee;Ignacio Aliagas;Jianwen A. Feng;Thomas Gabriel;T. J. O’Donnell;Benjamin D. Sellers;Bernd Wiswedel;Alberto Gobbi
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
69.Comparative analysis of chemical similarity methods for modular natural products with a hypothetical structure enumeration algorithm

机译：假设结构枚举算法对模块化天然产物化学相似性方法的比较分析
- 作者：Michael A. Skinnider;Chris A. Dejong;Brian C. Franczak;Paul D. McNicholas;Nathan A. Magarvey
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
70.Efficient conformational sampling and weak scoring in docking programs? Strategy of the wisdom of crowds

机译：对接程序中有效的构象采样和较弱的评分？人群智慧策略
- 作者：Ludovic Chaput;Liliane Mouawad
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
71.SimBoost: a read-across approach for predicting drug–target binding affinities using gradient boosting machines

机译：SimBoost：一种使用梯度增强机预测药物-靶标结合亲和力的跨方法
- 作者：Tong He;Marten Heidemeyer;Fuqiang Ban;Artem Cherkasov;Martin Ester
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
72.The comparison of automated clustering algorithms for resampling representative conformer ensembles with RMSD matrix

机译：用RMSD矩阵重采样代表性构象体集成的自动聚类算法的比较
- 作者：Hyoungrae Kim;Cheongyun Jang;Dharmendra K. Yadav;Mi-hyun Kim
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
73.Critical Assessment of Small Molecule Identification 2016: automated methods

机译：2016年小分子鉴定的关键评估：自动化方法
- 作者：Emma L. Schymanski;Christoph Ruttkies;Martin Krauss;Céline Brouard;Tobias Kind;Kai Dührkop;Felicity Allen;Arpana Vaniya;Dries Verdegem;Sebastian B?cker;Juho Rousu;Huibin Shen;Hiroshi Tsugawa;Tanvir Sajed;Oliver Fiehn;Bart Ghesquière;Steffen Neumann
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
74.A metadata-driven approach to data repository design

机译：元数据驱动的数据存储库设计方法
- 作者：Matthew J. Harvey;Andrew McLean;Henry S. Rzepa
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
75.CPANNatNIC software for counter-propagation neural network to assist in read-across

机译：CPANNatNIC软件，用于反向传播神经网络，以帮助进行交叉读取
- 作者：Viktor Drgan;?pela ?uperl;Marjan Vra?ko;Claudia Ileana Cappelli;Marjana Novi?
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
76.The polypharmacology browser: a web-based multi-fingerprint target prediction tool using ChEMBL bioactivity data

机译：多元药理学浏览器：使用ChEMBL生物活性数据的基于Web的多指纹目标预测工具
- 作者：Mahendra Awale;Jean-Louis Reymond
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
77.Adverse drug reactions triggered by the common HLA-B*57:01 variant: a molecular docking study

机译：常见的HLA-B * 57：01变体引发的药物不良反应：分子对接研究
- 作者：George Van Den Driessche;Denis Fourches
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
78.A possible extension to the RInChI as a means of providing machine readable process data

机译：可能对RInChI进行扩展，以提供机器可读的过程数据
- 作者：Philipp-Maximilian Jacob;Tian Lan;Jonathan M. Goodman;Alexei A. Lapkin
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
79.Comprehensive comparison of in silico MS/MS fragmentation tools of the CASMI contest: database boosting is needed to achieve 93% accuracy

机译：全面比较CASMI竞赛中的in silico MS / MS碎片化工具：需要提高数据库以实现93％的准确性
- 作者：Ivana Bla?enovi?;Tobias Kind;Hrvoje Torba?inovi?;Slobodan Obrenovi?;Sajjan S. Mehta;Hiroshi Tsugawa;Tobias Wermuth;Nicolas Schauer;Martina Jahn;Rebekka Biedendieck;Dieter Jahn;Oliver Fiehn
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
80.Computational methods using weighed-extreme learning machine to predict protein self-interactions with protein evolutionary information

机译：使用加权极限学习机的计算方法预测具有蛋白质进化信息的蛋白质自相互作用
- 作者：Ji-Yong An;Lei Zhang;Yong Zhou;Yu-Jun Zhao;Da-Fu Wang
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2017年第1期
81.An automated framework for QSAR model building

机译：QSAR模型构建的自动化框架
- 作者：Samina Kausar;Andre O. Falcao
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2018年第1期
82.3D-QSAR study of steroidal and azaheterocyclic human aromatase inhibitors using quantitative profile of protein–ligand interactions

机译：使用蛋白质-配体相互作用的定量分析对甾体和氮杂杂环人芳香酶抑制剂的3D-QSAR研究
- 作者：Sehan Lee;Mace G. Barron
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2018年第1期
83.LSTMVoter: chemical named entity recognition using a conglomerate of sequence labeling tools

机译：LSTMVoter：使用序列标记工具组合的化学命名实体识别
- 作者：Wahed Hemati;Alexander Mehler
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2019年第1期
- BioCreative V.5CEMPCHEMDNERBioNLPNamed entity recognitionDeep learningLSTMAttention mechanism;
84.QBMG: quasi-biogenic molecule generator with deep recurrent neural network

机译：QBMG：具有深度递归神经网络的准生物分子生成器
- 作者：Shuangjia Zheng;Xin Yan;Qiong Gu;Yuedong Yang;Yunfei Du;Yutong Lu;Jun Xu
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2019年第1期
- Deep learningRecurrent neural networksNatural productVirtual library;
85.Large scale comparison of QSAR and conformal prediction methods and their applications in drug discovery

机译：QSAR和保形预测方法的大规模比较及其在药物发现中的应用
- 作者：Nicolas Bosc;Francis Atkinson;Eloy Felix;Anna Gaulton;Anne Hersey;Andrew R. Leach
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2019年第1期
- QSARMondrian conformal predictionChEMBLClassification modelsCheminformatics;
86.A retrosynthetic analysis algorithm implementation

机译：反综合分析算法的实现
- 作者：Ian A. Watson;Jibo Wang;Christos A. Nicolaou
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2019年第1期
- Retrosynthetic analysisChemical synthesisSynthetic route designReaction informatics;
87.BioTransformer: a comprehensive computational tool for small molecule metabolism prediction and metabolite identification

机译：BioTransformer：用于小分子代谢预测和代谢物鉴定的综合计算工具
- 作者：Yannick Djoumbou-Feunang;Jarlei Fiamoncini;Alberto Gil-de-la-Fuente;Russell Greiner;Claudine Manach;David S. Wishart
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2019年第1期
- Metabolism predictionMetabolite identificationBiotransformationMicrobial degradationMass spectrometryMachine learningKnowledge-based systemStructure-based classificationMetabolic pathwayEnzyme-substrate specificity;
88.ParaDockS - an open-source framework for molecular docking: implementation of target-class-specific scoring methods

机译：ParaDockS-分子对接的开源框架：目标类特定计分方法的实现
- 作者：Michael Scharfe;Martin Pippel;Wolfgang Sippl
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
89.Predicting the protein targets for athletic performance-enhancing substances

机译：预测运动成绩增强物质的蛋白质靶标
- 作者：Lazaros Mavridis;John BO Mitchell
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
90.Stability of single and double layer fibrillar amyloid-β oligomers

机译：单层和双层原纤维淀粉样β-寡聚体的稳定性
- 作者：Anna Kahler;Anselm HC Horn;Heinrich Sticht
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
91.8th German Conference on Chemoinformatics

机译：第八届德国化学信息学会议
- 作者：Uli Fechner
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
92.Modeling of non-additive mixture properties using the Online CHEmical database and Modeling environment (OCHEM)

机译：使用在线化学数据库和建模环境（OCHEM）对非添加剂混合物特性进行建模
- 作者：Ioana Oprisiu;Sergii Novotarskyi;Igor V Tetko
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
93.PriaXplore? - a novel technology platform for the identification of small molecule modulators of protein-protein interactions

机译：PriaXplore？ -用于鉴定蛋白质-蛋白质相互作用的小分子调节剂的新型技术平台
- 作者：Susanne Eyrisch;Tobias Girschick;Günter Ross;Cédric Kalinski;Vladimir Khazak;Lutz Weber
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
94.Enhanced ranking of PknB Inhibitors using data fusion methods

机译：使用数据融合方法增强PknB抑制剂的排名
- 作者：Abhik Seal;Perumal Yogeeswari;Dharmaranjan Sriram;OSDD Consortium;David J Wild
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
95.InChI - the worldwide chemical structure identifier standard

机译：InChI-全球化学结构标识符标准
- 作者：Stephen Heller;Alan McNaught;Stephen Stein;Dmitrii Tchekhovskoi;Igor Pletnev
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
96.Using graph-based consensus clustering for combining K-means clustering of heterogeneous chemical structures

机译：使用基于图的共识聚类结合异构化学结构的K-均值聚类
- 作者：Faisal Saeed;Naomie Salim;Ammar Abdo;Hentabli Hamza
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
97.Predicting p K_avalues from EEM atomic charges

机译：根据EEM原子电荷预测p K _{a 值}
- 作者：Radka Svobodová Va?eková;Stanislav Geidl;Crina-Maria Ionescu;Ond?ej Sk?ehota;Tomá? Bouchal;David Sehnal;Ruben Abagyan;Jaroslav Ko?a
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
98.Visualizing chemical structure-subcellular localization relationships using fluorescent small molecules as probes of cellular transport

机译：使用荧光小分子作为细胞转运探针可视化化学结构-亚细胞定位关系
- 作者：Gus R Rosania;Kerby Shedden;Nan Zheng;Xinyuan Zhang
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
99.Defining a novel k-nearest neighbours approach to assess the applicability domain of a QSAR model for reliable predictions

机译：定义一种新颖的k最近邻方法来评估QSAR模型的适用范围以进行可靠的预测
- 作者：Faizan Sahigara;Davide Ballabio;Roberto Todeschini;Viviana Consonni
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期
100.The influence of the inactives subset generation on the performance of machine learning methods

机译：非活动子集生成对机器学习方法性能的影响
- 作者：Sabina Smusz;Rafa? Kurczab;Andrzej J Bojarski
- 期刊名称：《Journal of Cheminformatics》 | 2013年第s1期

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