グリシン,ジグリシン,トリグリシンを含む脂肪酸誘導体によるポリグリシンⅡ構造の形成

摘要

グリシン，ジグリシン，トリグリシンを部分構造とする脂肪酸型両親媒性分子を合成し，固体試料のFT-IRスぺクトルを測定した.これらの化合物は，いずれもアミドⅠ吸収帯が1650cm~(-1)と1640cm~(-1)に分裂する典型的なポリグリシンⅡ構造(3_1-ヘリックスのー衝)を形成していることがわかった.一方，トリアラニンやトリバリンを含む両親媒性分子を同じ固体試料で測定したところ，1630cm~(-1)付近の強い吸収から平行β-シートの形成が認められた.以前報告した逆平行β-シートの赤外スぺクトル(1690cm~(-1)付近の弱い吸収と1630cm~(-1)の強い吸収)をあわせると，トリペプチドが形成できる三つの二次構造(平行β-シート，逆平行β-シート，3_1-ヘリックス)すべての赤外スペクトルを得ることができ，小さなぺプチド断片が作る二次構造を診断するための指標を作ることができた.%We newly synthesized fatty acid-like amphiphiles that contain a glycine, diglycine, or triglycine residue, and investigated their hydrogen bonding modes. The FT-IR spectra of these amphiphiles showed a typical amide mode attributed to polyglycine Ⅱ (PGⅡ), which is called 3_1-helix in a broad sense. This mode was observed as a splitting band appearing at 1650 and 1640 cm~(-1). On the other hand, we have already shown the amide modes attributed to a β-sheet structure. The amide I mode of the parallel β-sheet gave a single peak at more than 1630 cm~(-1), whereas the antiparallel β-sheet absorbed at 1690 cm~(-1) (weak) and 1630 cm~(-1) (strong). The parallel β-sheet, antiparalle β-sheet, and PGⅡ are possible structures for a small peptide such as tripeptide, and hence, the spectral chart of the three structures, demonstrated in this study, should be helpful to diagnose a secondary structure of small peptide -containing molecules.