A mathematical approach to solve the network reconstruction problem

Wolfgang Marwan; Annegret Wagler; Robert Weismantel

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A mathematical approach to solve the network reconstruction problem

机译：解决网络重建问题的数学方法

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The reconstruction of biochemical and genetic networks from experimental data is an important challenge in biology and medical basic research. We formalize this problem mathematically and present an exact algorithm for its solution. Our procedure yields either a complete list of all alternative network structures that explain the observed phenomena or proves that no solution exists using the given data set.

机译：从实验数据重建生化和遗传网络是生物学和医学基础研究中的重要挑战。我们用数学的形式将这个问题形式化，并给出了解决该问题的精确算法。我们的过程将生成所有可解释网络现象的替代网络结构的完整列表，或者使用给定的数据集证明不存在任何解决方案。

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来源
《Mathematical Methods of Operations Research》 |2008年第1期|117-132|共16页
作者
Wolfgang Marwan; Annegret Wagler; Robert Weismantel;
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作者单位

Magdeburg Center of Systems Biology (MaCS) Otto-von-Guericke Universität Magdeburg Magdeburg Germany;

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收录信息
原文格式 PDF
正文语种 eng
中图分类
关键词
Modeling biological systems; Integer decomposition; Reverse engineering;

机译：生物系统建模;整数分解;逆向工程;

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