Y-specific sequences and polymorphisms in rainbow trout and Chinook salmon

摘要

Improved methods for genetically sexing salmonids and for characterization of Y-chromosome homologies between species can contribute to understanding the evolution of sex chromosomes and sex-determining mechanisms. In this study we have explored 12.5 kb of Y-chromosome-specific sequence flanking the previously described OtY2 locus in Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) and 21 kb of homologous rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) Y-chromosome-specific sequence. This is the first confirmed Y-specific sequence for rainbow trout. New Y-specific markers are described for Chinook salmon (OtY3) and rainbow trout (OmyY1), which are readily detected by PCR assays and are advantageous because they also produce autosomal control amplification products. Additionally, AFLP analysis of Chinook salmon yielded another potential Y-chromosome marker. These descriptions will facilitate genotypic sexing and should be useful for population studies of Y-chromosome polymorphisms and for future studies to characterize what appears to be a common sex-determining mechanism between these species.nnDe meilleures méthodes pour déterminer génétiquement le sexe des salmonidés et la caractérisation des homologies entre chromosomes Y chez diverses espèces peuvent contribuer à la compréhension de l'évolution des chromosomes sexuels et des mécanismes de déterminisme sexuel. Dans ce travail, les auteurs ont examiné 12,5 kb de séquence spécifique du chromosome Y flanquant le locus OtY2 décrit précédemment chez le saumon royal (Oncorhynchus tshawytscha) ainsi que 21 kb de séquence homologue spécifique du chromosome Y chez le saumon arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss). Il s'agit des premières séquences confirmées spécifiques du chromosome Y chez le saumon arc-en-ciel. De nouveaux marqueurs spécifiques du chromosome Y sont décrits pour le saumon royal (OtY3) et arc-en-ciel (OmyY1), lesquels sont détectables aisément en PCR et sont avantageux car ils produisent également des amplicons autosomiques comme témoins. De plus, des analyses AFLP du saumon royal ont révélé un autre marqueur potentiellement spécifique du chromosome Y. Ces descriptions faciliteront le sexage génotypique et devraient s'avérer utiles pour l'étude des polymorphismes du chromosome Y à l'échelle des populations ainsi que pour de futures études visant à caractériser ce qui semble un mécanisme commun de déterminisme sexuel chez ces espèces.