Mapping of markers related to self-incompatibility, disease resistance, and quality traits in Lolium perenne L.

摘要

Several linkage maps, mainly based on anonymous markers, are now available for Lolium perenne. The saturation of these maps with markers derived from expressed sequences would provide information useful for QTL mapping and map alignment. Therefore, we initiated a study to develop and map DNA markers in genes related to self-incompatibility, disease resistance, and quality traits such as digestibility and sugar content in two L. perenne families. In total, 483 and 504 primer pairs were designed and used to screen the ILGI and CLO-DvP mapping populations, respectively, for length polymorphisms. Finally, we were able to map 67 EST markers in at least one mapping population. Several of these markers coincide with previously reported QTL regions for the traits considered or are located in the neighbourhood of the self-incompatibility loci, S and Z. The markers developed expand the set of gene-derived markers available for genetic mapping in ryegrasses.nnPlusieurs cartes génétiques, principalement constituées de marqueurs anonymes, sont maintenant disponibles pour le Lolium perenne. La saturation de ces cartes à l'aide de marqueurs dérivés de séquences exprimées apporterait une information utile en vue de la cartographie de QTL et de l'alignement des cartes. Les auteurs ont donc initié ce travail dans le but principal de développer et de cartographier des marqueurs issus de gènes impliqués dans l'auto-incompatibilité, la résistance aux maladies et la qualité (tels que la digestibilité et la teneur en sucres) chez deux familles du L. perenne. Au total, 483 et 504 paires d'amorces ont été synthétisées et employées pour cribler, respectivement, les populations de cartographie ILGI et CLO-DvP en vue de trouver des polymorphismes de taille. Au terme de ce travail, 67 marqueurs EST ont été cartographiés sur au moins une population. Plusieurs de ces marqueurs coïncident avec des QTL rapportés antérieurement pour ces caractères ou sont situés à proximité des locus d'auto-incompatibilité S et Z. Les marqueurs ainsi mis au point contribuent à augmenter le nombre de marqueurs dérivés de gènes qui sont disponibles pour la cartographie génétique chez les ray-grass.