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DRTF: a database of rice transcription factors

机译:DRTF:水稻转录因子数据库

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摘要

Summary: DRTF contains 2025 putative transcription factors (TFs) in Oryza sativa L. ssp. indica and 2384 in ssp. japonica, distributed in 63 families, identified by computational prediction and manual curation. It includes detailed annotations of each TF including sequence features, functional domains, Gene Ontology assignment, chromosomal localization, EST and microarray expression information, as well as multiple sequence alignment of the DNA-binding domains for each TF family. The database can be browsed and searched with a user-friendly web interface.
机译:摘要:DRTF在水稻(Oryza sativa L. ssp。)中含有2025个假定的转录因子(TF)。印度和2384 SSP。粳稻,分布在63个科中,通过计算预测和手动管理进行识别。它包括每个TF的详细注释,包括序列特征,功能域,基因本体论分配,染色体定位,EST和微阵列表达信息,以及每个TF家族的DNA结合域的多序列比对。可以使用用户友好的Web界面浏览和搜索数据库。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2006年第10期|1286-1287|共2页
  • 作者单位

    Center for Bioinformatics National Laboratory of Protein Engineering and Plant Genetic Engineering College of Life Sciences Peking UniversityBeijing 100871 People's Republic of China;

    The Institute of Theoretical Physics Chinese Academy of SciencesBeijing 100080 People's Republic of China;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
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