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Cytoscape ESP: simple search of complex biological networks

机译:Cytoscape ESP:复杂生物网络的简单搜索

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摘要

Summary: Cytoscape enhanced search plugin (ESP) enables searching complex biological networks on multiple attribute fields using logical operators and wildcards. Queries use an intuitive syntax and simple search line interface. ESP is implemented as a Cytoscape plugin and complements existing search functions in the Cytoscape network visualization and analysis software, allowing users to easily identify nodes, edges and subgraphs of interest, even for very large networks.
机译:简介:Cytoscape增强型搜索插件(ESP)支持使用逻辑运算符和通配符在多个属性字段上搜索复杂的生物网络。查询使用直观的语法和简单的搜索行界面。 ESP作为Cytoscape插件实现,并补充了Cytoscape网络可视化和分析软件中现有的搜索功能,即使对于非常大的网络,用户也可以轻松识别感兴趣的节点,边线和子图。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2008年第12期|1465-1466|共2页
  • 作者单位

    Robert H. Smith Institute of Plant Sciences and Genetics in Agriculture Hebrew University of Jerusalem Rehovot Israel;

    Terrence Donnelly Centre for Cellular and Biomolecular Research University of Toronto Toronto ON Canada;

    Agilent Technologies Santa Clara CA and;

    Center for Computational Medicine and Biology University of Michigan Ann Arbor MI USA;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
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