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TaxonGap: a visualization tool for intra- and inter-species variation among individual biomarkers

机译:TaxonGap:一种可视化工具,用于在单个生物标记之间进行种内和种间变异

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摘要

Summary: Selection of optimal biomarkers for the identification of different operational taxonomic units (OTUs) may be a hard and tedious task, especially when phylogenetic trees for multiple genes need to be compared. With TaxonGap we present a novel and easy-to-handle software tool that allows visual comparison of the discriminative power of multiple biomarkers for a set of OTUs. The compact graphical output allows for easy comparison and selection of individual biomarkers.
机译:简介:选择最佳的生物标记物来鉴定不同的操作分类单位(OTU)可能是一项艰巨而繁琐的任务,尤其是当需要比较多个基因的系统树时。借助TaxonGap,我们提供了一种新颖且易于使用的软件工具,该工具可以直观地比较多个生物标记物对一组OTU的判别力。紧凑的图形输出可轻松比较和选择单个生物标记。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2008年第6期|p.866-867|共2页
  • 作者单位

    1KERMIT, Research Unit Knowledge-based Systems, Ghent University, Coupure links 653, 2Department of Applied Mathematics and Computer Science, Ghent University, Krijgslaan 281 (S9) and 3Laboratory of Microbiology, Ghent University, K.L. Ledeganckstraat 35, 9000 Ghent, Belgium;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
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