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Template-free detection of macromolecular complexes in cryo electron tomograms

机译:无模板的低温电子断层图中大分子复合物的检测

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摘要

Motivation: Cryo electron tomography (CryoET) produces 3D density maps of biological specimen in its near native states. Applied to small cells, cryoET produces 3D snapshots of the cellular distributions of large complexes. However, retrieving this information is non-trivial due to the low resolution and low signal-to-noise ratio in tomograms. Current pattern recognition methods identify complexes by matching known structures to the cryo electron tomogram. However, so far only a small fraction of all protein complexes have been structurally resolved. It is, therefore, of great importance to develop template-free methods for the discovery of previously unknown protein complexes in cryo electron tomograms.
机译:动机:低温电子断层扫描(CryoET)可以在其原始状态下生成生物标本的3D密度图。应用于小型细胞时,cryoET可以生成大型复合物细胞分布的3D快照。但是,由于断层图中的分辨率低和信噪比低,因此检索此信息并非易事。当前的模式识别方法通过将已知结构与低温电子断层图匹配来识别复合物。但是,到目前为止,所有蛋白质复合物中只有一小部分已在结构上得到解析。因此,开发无模板的方法来发现低温电子断层图中以前未知的蛋白质复合物非常重要。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2011年第13期|p.69-76|共8页
  • 作者

    Frank Alber;

  • 作者单位
  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
  • 关键词

  • 入库时间 2022-08-18 01:12:43

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