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RazerS 3: Faster, fully sensitive read mapping

机译:RazerS 3:更快,完全敏感的读取映射

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摘要

Motivation: During the past years, next-generation sequencing has become a key technology for many applications in the biomedical sciences. Throughput continues to increase and new protocols provide longer reads than currently available. In almost all applications, read mapping is a first step. Hence, it is crucial to have algorithms and implementations that perform fast, with high sensitivity, and are able to deal with long reads and a large absolute number of insertions and deletions.
机译:动机:在过去的几年中,下一代测序已成为生物医学中许多应用的关键技术。吞吐量继续增加,新协议提供的读取时间比当前可用的读取时间更长。在几乎所有应用程序中,读取映射都是第一步。因此,至关重要的是要具有能够快速执行,具有高灵敏度并且能够处理长读取以及大量绝对的插入和删除操作的算法和实现。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2012年第20期|p.2592-2599|共8页
  • 作者单位

    Department of Mathematics and Computer Science, Freie Universität Berlin, Takustr. 9, 14195 Berlin, Germany;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
  • 关键词

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