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CistromeMap: a knowledgebase and web server for ChIP-Seq and DNase-Seq studies in mouse and human

机译:CistromeMap:用于在小鼠和人类中进行ChIP-Seq和DNase-Seq研究的知识库和Web服务器

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摘要

Summary: Transcription and chromatin regulators, and histone modifications play essential roles in gene expression regulation. We have created CistromeMap as a web server to provide a comprehensive knowledgebase of all of the publicly available ChIP-Seq and DNase-Seq data in mouse and human. We have also manually curated metadata to ensure annotation consistency, and developed a user-friendly display matrix for quick navigation and retrieval of data for specific factors, cells and papers. Finally, we provide users with summary statistics of ChIP-Seq and DNase-Seq studies.
机译:简介:转录和染色质调节剂以及组蛋白修饰在基因表达调节中起重要作用。我们已经创建了CistromeMap作为网络服务器,以提供有关鼠标和人类中所有公共可用的ChIP-Seq和DNase-Seq数据的全面知识库。我们还手动整理了元数据以确保注释的一致性,并开发了用户友好的显示矩阵,可快速导航和检索特定因素,单元格和纸张的数据。最后,我们为用户提供ChIP-Seq和DNase-Seq研究的摘要统计信息。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2012年第10期|p.1411-1412|共2页
  • 作者

    X. Shirley Liu;

  • 作者单位
  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
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