tPatternHunter: gapped, fast and sensitive translated homology search

Kisman D; Li M; Ma B; Wang L

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tPatternHunter: gapped, fast and sensitive translated homology search

机译：tPatternHunter：缺口，快速和敏感的翻译同源性搜索

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SUMMARY: New ideas, spaced seeds and gapped alignment before 6-frame translation are implemented for translated homology search in tPatternHunter. The new software compares favorably with tBLASTx. AVAILABILITY: The software is free to academics at http://www.bioinformaticssolutions.com/downloads/ph-academic/ CONTACT: bma@csd.uwo.ca.

机译：简介：在tPatternHunter中为翻译的同源性搜索实现了6帧翻译之前的新思路，间隔种子和空位对齐。新软件与tBLASTx相比具有优势。可用性：该软件对学者免费，网址为http://www.bioinformaticssolutions.com/downloads/ph-academic/联系人：bma@csd.uwo.ca。

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来源
《Bioinformatics》 |2005年第4期|p.542-544|共3页
作者
Kisman D; Li M; Ma B; Wang L;
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作者单位

Bioinformatics Solutions Inc. 145 Columbia St West, Waterloo, Ontario, Canada N2L 3L2.;

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收录信息美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
原文格式 PDF
正文语种 eng
中图分类生物科学;生物工程学（生物技术）;
关键词
入库时间 2022-08-17 23:50:01

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