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SCASP: A Simple and Robust SDS-Aided Sample Preparation Method for Proteomic Research

机译:SCASP:一种简单且坚固的SDS辅助样品制备方法用于蛋白质组学研究

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摘要

SDS is widely used in sample preparation for proteomic research. However, SDS is incompatible with LC and electrospray ionization. SDS depletion is therefore required ahead of LC–MS analysis. Most of current SDS removal strategies are time consuming, laborious, and have low reproducibility. Here, we describe a method, SDS–cyclodextrin (CD)-assisted sample preparation, by which CD can bind to SDS and form CD–SDS complexes in solutions, allowing for direct tryptic digestion. We demonstrate that SDS–CD-assisted sample preparation is a simple, fast, and robust SDS-based sample preparation method for proteomics application.
机译:SDS广泛用于蛋白质组学研究的样品制备中。然而,SDS与LC和电喷雾电离不相容。因此,在LC-MS分析之前需要SDS耗尽。目前的大部分SDS去除策略是耗时,费力,并且重复性低。在此,我们描述了一种方法,Sds-Cycleodextrin(CD) - 配合样品制剂,CD可以与SDS结合并在溶液中形成CD-SDS复合物,允许直接胰蛋白酶消化。我们证明SDS-CD辅助样品制剂是蛋白质组学应用的简单,快速,基于SDS的SDS的样品制备方法。

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