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STRAW: Species TRee Analysis Web server

机译:STRAW:Species TRee分析Web服务器

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摘要

The coalescent methods for species tree reconstruction are increasingly popular because they can accommodate coalescence and multilocus data sets. Herein, we present STRAW, a web server that offers workflows for reconstruction of phylogenies of species using three species tree methods—MP-EST, STAR and NJst. The input data are a collection of rooted gene trees (for STAR and MP-EST methods) or unrooted gene trees (for NJst). The output includes the estimated species tree, modified Robinson-Foulds distances between gene trees and the estimated species tree and visualization of trees to compare gene trees with the estimated species tree. The web sever is available at .
机译:用于树种重构的合并方法越来越受欢迎,因为它们可以容纳合并和多位点数据集。在这里,我们介绍了STRAW,这是一个网络服务器,它提供了使用三种树种方法(MP-EST,STAR和NJst)重建物种系统发育的工作流程。输入数据是有根基因树(用于STAR和MP-EST方法)或无根基因树(用于NJst)的集合。输出包括估计的物种树,基因树与估计的物种树之间的修改的Robinson-Foulds距离以及树的可视化,以将基因树与估计的物种树进行比较。可在以下位置获取网络服务器。

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