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Positional Information Positional Error and Readout Precision in Morphogenesis: A Mathematical Framework

机译:形态发生中的位置信息位置误差和读出精度:一个数学框架

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摘要

The concept of positional information is central to our understanding of how cells determine their location in a multicellular structure and thereby their developmental fates. Nevertheless, positional information has neither been defined mathematically nor quantified in a principled way. Here we provide an information-theoretic definition in the context of developmental gene expression patterns and examine the features of expression patterns that affect positional information quantitatively. We connect positional information with the concept of positional error and develop tools to directly measure information and error from experimental data. We illustrate our framework for the case of gap gene expression patterns in the early Drosophila embryo and show how information that is distributed among only four genes is sufficient to determine developmental fates with nearly single-cell resolution. Our approach can be generalized to a variety of different model systems; procedures and examples are discussed in detail.
机译:位置信息的概念是我们了解细胞如何确定其在多细胞结构中的位置以及由此决定其发育命运的核心。然而,位置信息既没有在数学上定义也没有以原则性的方式量化。在这里,我们在发育基因表达模式的背景下提供了信息理论的定义,并研究了定量影响位置信息的表达模式的特征。我们将位置信息与位置误差的概念联系起来,并开发工具来直接测量实验数据中的信息和误差。我们为果蝇早期胚胎中的间隙基因表达模式的情况说明了我们的框架,并展示了仅在四个基因之间分布的信息如何足以确定具有几乎单细胞分辨率的发育命运。我们的方法可以推广到各种不同的模型系统。程序和示例进行了详细讨论。

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