金银花中表达基因密码子偏好性分析

摘要

密码子是生物体中重要的遗传信息载体,经过长期进化,不同的生物体对同一密码子形成了一定程度的使用偏好性。本研究对已获得的金银花转录组进行基因预测,利用CodonW程序对所有含有完整阅读框的预测基因,以及参与绿原酸合成的羟基化肉桂酰转移酶（HQT）基因进行密码子偏好性分析。并将HQT基因与大肠杆菌、酵母和拟南芥全基因组的密码子使用频率进行比较,为在细菌、真菌和植物中表达金银花中HQT基因,或通过合成生物学手段异源合成绿原酸奠定了前期研究基础。